Jinbee es un joven guerrero que toma el puesto de su padre como candidato a Mushibugyo, responsables en Edo de acabar con unos insectos gigantes que destrozan todo lo que encuentran a su paso. Lo que no esperaba es que un Mushibugyo fuera tan poderoso, pues conoce a algunos de los miembros del escuadrón: un experto en explosivos, un experto en defensa, un experto en armas cuerpo a cuerpo y un experto en atacar el punto débil de los insectos. Lo que al inicio fue solo un mandato de su padre acaba convirtiéndose en un deseo propio ante la admiración que le despiertan tales personas, y así protegerá Edo con todas sus fuerzas.

Basado en el juego de Atlus, la historia nos sitúa en Japón, que está siendo invadido por extrañas criaturas conocidas como Septentriones, que acabarán con el mundo en 7 días. Mientras tanto, 13 humanos elegidos deberán formar contratos con demonios para poder salvar a la Tierra de estos invasores del espacio.

La humanidad fue casi exterminada con la repentina aparición de seres humanoides, conocidos como Titanes. Criaturas de enorme tamaño, con forma humana y aparentemente poca inteligencia, que comen humanos. Debido al tamaño de los Titanes, que van de 3 a 15 metros de altura, la humanidad fue devorada sin contemplación, no obstante, un grupo reducido de humanos pudo sobrevivir dentro de una enorme área de terreno amurallada, protegida por muros de 50 metros de altura, el triple de la altura de los gigantes más altos registrados hasta la fecha de su construcción.

107 años después, la humanidad vive pacíficamente dentro de las murallas y no ha sido testigo de ataques por parte de los Titanes durante todo ese tiempo, hasta que un día, el joven, Eren Jaeger y su hermana adoptiva, Mikasa Ackerman, presencian como un Titán tan alto como la propia muralla, al que se le conoce posteriormente como Titán Colosal, hace repentinamente su aparición, haciendo una abertura en una de las murallas exteriores de la ciudad, lo que permite la entrada de un gran grupo de Titanes de menor tamaño. Ambos jóvenes ven con horror como su madre es devorada viva por uno de ellos. Tras haber sobrevivido al ataque, Eren jura eliminar a todos los Titanes, en venganza por la muerte de su madre.

El rey demonio satán, la encarnación del terror y la crueldad, quien decidido a conquistar el mundo y sumirlo en una nueva era de oscuridad, declara la guerra a la humanidad teniendo como sus cuatro generales de batalla a los demonios más fuertes de su reino; Adeamelesh, lucifer, al siel y malacoda, atacando simultáneamente las cuatro islas a su alrededor, sumergiendo poco a poco a la humanidad en el dolor y la destrucción. Sin embargo, un héroe se alzó por encima del resto de la humanidad en un afán por salvar al mundo de la destrucción total, logrando junto a su sequito destruir uno a uno, a tres de los cuatro generales del rey satan. Acorralado en batalla por el héroe y su sequito, el rey demonio satán reconociendo su derrota decide retirarse junto con su ultimo general vivo Asliel, a una dimensión alterna a recuperar sus fuerzas mágicas para volver y esta vez sí destruir la humanidad y conquistar el mundo completamente. Al despertar en el nuevo mundo el rey demonio se da cuenta de que ahora es humano y que no posee casi nada de magia, lo que le obliga a afrontar una vida de retos cotidianos como todos los demás humanos de este nuevo mundo.

La diosa Athena que gobierna en paz la Tierra, continúa la batalla contra los dioses que intentan la supremacía sobre este mundo. Los Caballeros pelean para proteger a Athena de los dioses malignos mediante el uso del cosmos, la energía de sus cuerpos usan una cloth que pertenecen a sus constelaciones protectoras.

Años después de la era de Saint Seiya, Marte el dios de la guerra, desciende a la Tierra con la intención de instaurar un nuevo orden y gobernar asi el planeta.

Saku Ōyagi es un adicto a los libros que vuelve después de algunos años a su ciudad natal para entrar como novato a la escuela. En su primer día de clases se encuentra con su amiga de la infancia Mihoshi Akeno, aunque su relación de amigos terminó algo incomoda dado un evento traumático en el pasado. Sin embargo, Mihoshi invita a Saku al club de astronomía que ella fundó.

La historia gira en torno a Mahiro Fuwa, un adolescente cuya familia fue asesinada misteriosamente un año antes, y su amigo Yoshino Takigawa. Mahiro es contactado por Hakaze Kusaribe, líder del clan Kusaribe, Mahiro se compromete a ayudar a Hakaze a cambio de su ayuda para encontrar al culpable de la muerte de su familia. Al enterarse de las intenciones de su amigo, Yoshino se une a él en su búsqueda para enfrentarse al clan Kusaribe que tiene la intención de despertar el "Árbol de Zetsuen", cuyo poder puede llevar a la ruina a todo el mundo.

La historia tiene lugar en una villa subterranea llamada Shiiha. Ellos han vivido ahi­ desde que un terremoto enterró su pueblo hace cientos de años. Simon es un chico de esta villa, se dedica a hacer agujeros para incrementar el area habitable. Un di­a, cavando profundo dentro de un tunel, encuentra un objeto cristalino brillante, un "core drill". El mejor amigo de Simon es otro chico llamado Kamina, quien lidera un grupo llamado "gren-dan" que intenta atravesar el techo de la caverna y volver a la superficie. Un di­a, un evento que ocurrió cambió todo. El techo de la cueva se rompió y un robot gigante cayó al pueblo. La luz del sol penetró por el agujero dejado en el techo.

"En realidad habi­a una superficie en el mundo!". Pero no habi­a tiempo para pensar. El robot gigante empezó a destruir su villa. Inmediatamente Kamina se le enfrentó. Pero, una persona no podi­a hacer nada. La vida de Kamina fue apenas salvada por una chica de la superficie llamada Yoko. Ella disparó de su rifle y detuvo al robot y llamó al robot gigante un "ganmen". Pero el rifle solo pudo atrasarlo. Luego de varios peligros, Simon les mostró una cara robótica gigante que desenterró de la cueva anteriormente. Kamina dijo "Lo desenterraste, pilotealo!", la responsabilidad fue puesta en Simon. Cuando puso el "core drill", se activó. Por alguna razón Simon ya sabi­a como controlarlo. Sin pensarlo, se subió a la cabeza gigante. Kamina la llamó el robot Lagann.

La historia se desarrolla en un futuro post-apocaliptico donde millones de personas han caido en letargo para salvaguardar lo pocos recursos que quedan. Unas pocas almas despertadas tratarán de rescatar al resto de la población durmiente

El argumento de la serie se centra en la historia de un grupo de jóvenes guerreros denominados «santos» (o «caballeros»), cuyo protagonista principal es Seiya (Santo o caballero que porta la armadura (Cloth) de Pegaso). Estos guerreros luchan por proteger a la diosa griega Atenea y a la humanidad de las fuerzas del mal que quieren dominar la Tierra. Para sus batallas, cada santo utiliza su energía interior ligada al universo (el «cosmos»), sus técnicas especiales de lucha, y sus armaduras (originalmente llamada cloth),todas inspiradas en cada una de las 88 constelaciones, las cuales los representan como caballeros o Santos de Atena y los protegen en los combates.